Reshape, laboratuvar deneylerinin ‘görsel’ kısmını otomatikleştirerek ‘doğanın kodunu çözmeye’ yardımcı olmak istiyor

Danimarkalı bir girişim Ar-Ge ekiplerinin görsel incelemeler gerektiren laboratuvar deneylerini otomatikleştirmesine yardımcı olmak ve teknolojisini ABD’de ölçeklendirmek için A Serisi finansmanla 20 milyon dolar toplamak istiyor

2018 yılında Kopenhag’da kurulan Reshape, bilim adamlarının Petri kapları ve benzer plaka formatlarındaki görsel değişiklikleri (renk veya hücre büyüme oranları gibi) takip etmelerine yardımcı olmak için yazılım ve yapay zeka modelleriyle dolu bir robotik görüntüleme sistemi geliştirdi. Makineleri, deneylerin kolayca tekrarlanabilmesini sağlamak için ilgili verilerin kaydedildiği, belirli sıcaklıklara ayarlanabilen yerleşik bir inkübasyona sahiptir.

Bunun faydası, bu deneylerin doğrudan denetim olmadan 7/24 gerçekleştirilebilmesi ve teknisyenlere diğer kritik görevler için zaman kazandırmasıdır.

“Doğanın şifresini çözmek”

Reshape’in ulaşmak istediği şeyin merkezinde “doğanın şifresini çözme” kavramı yer alıyor ve doğal ve üretilmiş dünyalar arasındaki çizgilerin bulanıklaştığını gören daha geniş bir trend üzerine inşa ediliyor. Biyoloji “mühendisliği” yapmayı amaçlayan teknolojilere akıtılan sayısız paranın da gösterdiği gibi, Silikon Vadisi’nde bu fırsatlar kaçırılmadı.

“Biyoloji bir bütün olarak bir bilimden mühendislik disiplinine geçiş yapıyor ve bence yapmak istediğimiz en büyük şeylerden biri bazı ‘somut olmayan’ şeyleri – bir nesne nasıl büyür, nasıl davranır? – tarif etmesi daha kolay,” Reshape CEO’su Carl-Emil Grøn TechCrunch’a söyledi. “İdeal olarak, gerçek dünyada olanlar ile DNA’nızda olanlar arasındaki çeviri katmanını nasıl oluşturduğumuzu bulmak istiyoruz.”

Reshape’in doğuşu, kendisi de mühendislik geçmişine sahip olan Grøn’un, biyoteknoloji endüstrisinde çalışan biriyle çıkmaya başlaması ve ona laboratuvar deneylerinde yer alan manuel çabanın miktarı hakkında fikir vermesiyle ortaya çıktı.

Grøn, “Biyoteknolojinin büyük ölçüde otomatikleştirildiğini varsaydım, ancak beş ay boyunca her günün sekizinci saatinde laboratuvara gidip bir Petri kabının fotoğrafını çekmek zorunda kaldı” dedi. “Teknoloji dünyasından olduğunuzda, bu çok çılgınca görünüyordu.”

Kopenhag bölgesindeki bir grup biyoteknoloji şirketiyle konuştuktan sonra Grøn, ilk deneyiminin tuhaf bir anormallik olmadığını fark etti: Laboratuvarların DNA dizilemesi yapma, kimyasal bileşimleri ölçme ve geri kalan her şey aşağı yukarı hâlâ gerçekleşiyordu. bir asırdan fazla bir süredir yapıldığı gibi.

Bu nedenle Grøn, iki kurucu ortak olan Daniel Storgaard ve Magnus Madsen’i görevlendirdi ve görsel veri noktalarını ve hızlandırılmış çekimleri yakalamak ve belirli bir bileşendeki farklı bileşenlerin nasıl değiştiğini kaydetmek için yüksek çözünürlüklü kameralar ve ışıklandırmayla dolu tam kapsamlı bir platform oluşturmaya başladı. Deney, maruz kaldıkları koşullara tepki verir.

Kaputun altında

Reshape, kendi laboratuvarında şirket içi veriler üzerine eğitilmiş kendi yapay zeka modellerini geliştiriyor ve bunlar, mantar veya bakteri konakçıları veya tohumlar ve böcekleri içerenler gibi daha yaygın deney türlerinden bazıları için başlangıçtan itibaren işe yarayabilir. Ancak şirket aynı zamanda müşterilerinin belirli mikropların belirli koşullar altında nasıl davrandığını takip etmek gibi belirli kullanım durumları için modeller eğitmelerine de yardımcı olabiliyor.

“Reshape veri bilimi ekibi, özel olarak oluşturulmuş MLops mimarimizi kullanarak, istenen çıktıyı ve ölçümü anlamaktan başlayarak, gerekli veri kümelerine uygun ölçekte açıklama eklemek, modeller geliştirmek ve kıyaslamak ve ardından bunları bizim sistemimizde dağıtmak suretiyle bu işi uçtan uca ele alıyor. müşterilerimiz için bir ürün,” dedi Grøn.

Örneğin bir tarım şirketi, tohum çimlenme oranlarını veya belirli bir hastalığın ciddiyetini test etmek için Reshape’i kullanabilir. Veya bir gıda şirketi, kaliteyi, tazeliği veya bileşenlerin zaman içinde nasıl olgunlaştığını (genellikle görsel değerlendirme gerektiren herhangi bir şeyi) test etmek için içerik karakterizasyonunu gerçekleştirebilir.

Bazı Reshape müşterileri, platform teknolojisini kimyasallardan biyo-pestisitlere geçiş yapmak için kullanıyor; temel olarak hangi yeni bileşiklerin en iyi şekilde çalıştığını bulmak ve bunların nasıl yapıldığını kaydetmek. Ve hız, sonuçta müşteriler için ana çekiciliktir.

Grøn, “Daha önce yapabileceklerinden dört ila 10 kat daha fazla deney yapacaklar, bu da ürünleri pazara çok daha hızlı sunabilecekleri anlamına geliyor” dedi.

Reshape, sonuçların bulut tabanlı bir arayüzde görüntülenmesini sağlıyor ancak platform aynı zamanda LIMS veya CSV gibi formatlarda veri aktarımını da destekleyerek kullanıcıların verilerini Benchling gibi diğer biyoteknoloji yazılımlarına ve hatta yalnızca Excel’e taşımalarına olanak tanıyor.

Doğruluk açısından Grøn, temeldeki modelleri aynı deneyde bir insanın performansıyla karşılaştırdığını ve yanlış negatifler gibi ölçümleri kapsadığını söylüyor. Bu, bilim insanının deneyin etkisiz olduğunu düşünmesi nedeniyle deneyin yarıda kesilebileceği senaryoların önlenmesine yardımcı olur.

Grøn, “Yanlış negatiflerde yaklaşık %80’lik bir azalmaya yardımcı oluyoruz” dedi. “Ayrıca müşterilerimizin sonuç almak için ihtiyaç duydukları süreyi azaltmalarına da yardımcı oluyoruz. Ve birkaç yıl önce bir deneyi nasıl yaptığınızı hatırlamaya güvenmek yerine, onu mükemmel bir şekilde takip ediyoruz. Yani platformda her deneme çalıştırdığınızda onu izleriz; tekrarlanabilirlik son derece önemlidir.”

İş modeli açısından Reshape, donanımı, makine öğrenimini ve temel yazılımı içeren platformun tamamını bir abonelik olarak satıyor. Fiyatlandırma, her müşteriye göre değişebilen “değer bazlı” fiyatlandırma modeli üzerinden ücretlendirilir.

Şimdilik Reshape yalnızca tek boyutta makine gönderiyor; yani bir müşterinin çok sayıda deneyi varsa, çok sayıda makine alması gerekir. Yani bunu devasa endüstriyel sınıf deneylere ölçeklendirmek için Reshape’in daha büyük makinelere ihtiyacı olabilir; Grøn bu konuda biraz çekingen davrandı ancak gelecekte daha büyük cihazlara “dallanabileceklerini” öne sürdü.

Büyüme

Y Combinator’ın (YC) Kış 2021 serisinden mezun olan Reshape, aralarında İsviçre tarım teknolojisi devi Syngenta ve Oxford Üniversitesi’nin de bulunduğu oldukça etkileyici bir müşteri listesi oluşturdu. Geçen yılki 8,1 milyon dolarlık başlangıç ​​turunun ardından bankada 20 milyon dolar daha bulunan Reshape, yeni nakit enjeksiyonunu ABD’deki işini ölçeklendirmek için kullanmayı planladığını söylüyor; her ne kadar gelirinin yaklaşık üçte ikisinin zaten bu bölgeden geldiğini söylüyor çoğunlukla Avrupalı ​​müşterilerinin ABD tesislerinden.

Grøn, “Teknolojimizin işe yaradığını kanıtladık; artık mesele onu ölçeklendirmek ve biyolojik geçişi hızlandırmak için mümkün olduğu kadar çok laboratuvara yardım etmek.” dedi.

Diğerleri de, daha geniş laboratuvar iş akışını hedeflemek için geçen yıl 40 milyon dolar toplayan Londra’daki Automata dahil olmak üzere bilim laboratuvarlarına otomasyon getiriyor. Singer Instruments’ın Phenobooth’u ve Interscience’ın ScanStation’ı gibi bazı şirketler de Reshape’in yapmaya çalıştığı şeye benzer bir şey sunuyor.

Ancak Grøn, uçtan uca veri yönetimiyle tamamlanan ve anında kullanıma uygun tam yığın bir platform sağlayarak Reshape’i farklı kılan şeyin bu olduğunu düşünüyor.

Grøn, “Bu, birçok şirketin uzun süredir çözmeye çalıştığı pahalı bir sorundur” dedi. “Kuluçka, görüntü yakalama ve analizi kapalı devre bir sistemde sağlıyoruz. Önceden eğitilmiş modellerimiz kutudan çıktığı gibi kullanıma hazırdır ve zaman alan bir eğitim gerektirmez.”

Reshape’in A Serisi turu, YC, R7, ACME, 21stBio ve Unity kurucu ortağı Nicholas Francis’in katılımıyla Avrupalı ​​VC firması Astanor Ventures tarafından yönetildi.

Kaynak: https://techcrunch.com/2024/04/09/reshape-wants-to-accelerate-biotech-rd-by-bringing-computer-vision-to-lab-experiments/